要在从RecyclerView中淡入新的Activity时使用overridePendingTransition方法，需要在调用startActivity之后立即调用overridePendingTransition方法。以下是一个示例代码：

// 在RecyclerView的Adapter中的点击事件处理方法中调用
@Override
public void onClick(View view) {
    // 获取当前点击的位置
    int position = getAdapterPosition();

    // 创建Intent对象，用于启动新的Activity
    Intent intent = new Intent(mContext, NewActivity.class);
    
    // 调用startActivity方法启动新的Activity
    mContext.startActivity(intent);
    
    // 调用overridePendingTransition方法设置淡入的动画效果
    ((Activity) mContext).overridePendingTransition(android.R.anim.fade_in, android.R.anim.fade_out);
}

在这个示例中，我们在RecyclerView的Adapter中的点击事件处理方法中调用了startActivity方法启动新的Activity，并立即调用overridePendingTransition方法设置淡入的动画效果。请注意，我们需要将mContext转换为Activity对象，以便调用overridePendingTransition方法。

这样，当用户点击RecyclerView中的项时，将会淡入显示新的Activity。