要解决"Advanced Installer MSI - 该软件包只能通过引导程序运行"的问题，您需要在安装程序中添加一些代码来执行所需的操作。以下是一个示例代码，可以在Advanced Installer中使用：

using System;
using System.Diagnostics;
using System.IO;

namespace MyAppInstaller
{
    class Program
    {
        static void Main(string[] args)
        {
            // 获取当前安装程序的路径
            string currentDirectory = Path.GetDirectoryName(Process.GetCurrentProcess().MainModule.FileName);

            try
            {
                // 执行您的安装逻辑
                Console.WriteLine("开始安装...");

                // 在这里执行您的安装操作，例如复制文件、创建注册表项等等

                Console.WriteLine("安装完成。");
            }
            catch (Exception ex)
            {
                // 发生错误时打印错误消息
                Console.WriteLine("安装过程中发生错误: " + ex.Message);
            }

            // 等待用户按下任意键继续
            Console.WriteLine("按下任意键继续...");
            Console.ReadKey();
        }
    }
}

在这个示例代码中，我们使用C#编写了一个控制台应用程序，在安装过程中执行了一些操作。您可以根据自己的需求修改并扩展此示例代码。

请注意，在使用Advanced Installer时，您需要将此代码添加到您的项目中，并在Advanced Installer中配置引导程序来运行此代码。在Advanced Installer中，您可以在"Launch Conditions"（启动条件）和"Custom Actions"（自定义操作）部分配置引导程序。

希望这个示例代码能帮助您解决问题！