adonis2PERMANOVA（vegan包）能否包含重复测量？ _编程开发

创始人

2024-07-28 15:31:23

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在adonis2 PERMANOVA（vegan包）中，重复观测数据可以被包含。可以使用组变量并在模型中包含重复度，表示每个样本的多个测量。这可以使用“strata”选项来完成。例如：

adonis2(formula = distance ~ group, data = mydata, permutations = 999, strata = subject)

在这个例子中，数据框“mydata”包含一个数值型响应变量（“distance”）和一个组变量（“group”），并且还有一个表示每个样本的主题标识的重复度变量（“subject”）。

值得注意的是，在使用adonis2进行PERMANOVA分析时，重复测量应仅用于观测值对应于同一响应变量的情况下。因此，我们需要确保使用的数据符合这个条件。

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