adonis2的结果取决于变量的顺序,我该如何解释这些结果?
创始人
2024-07-28 15:30:06
0

在R语言中,当运行adonis2时,结果可能会受到变量顺序的影响。假设我们有以下数据集:

library(vegan)
data(varespec)
data(varechem)

我们可以运行以下命令来运行adonis2:

adonis2(varespec ~ varechem$Al + varechem$Ca,METHOD="bray", permutations = 999)

这样运行adonis2的结果可能与我们改变变量顺序后运行adonis2的结果不同。例如,我们重新安排变量:

adonis2(varespec ~ varechem$Ca + varechem$Al,METHOD="bray", permutations = 999)

这可能会生成与之前不同的结果。

为了解决这个问题,我们可以使用permutational multivariate analysis of variance MANOVA进行多元方差分析。以下是一个示例代码:

manova(vegdist(varespec, method = "bray") ~ varechem$Al+varechem$Ca)

这样的结果不会受到变量顺序的影响,因此更可靠。

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