要在Acrobat JavaScript中填写表单并将其保存到多个文件夹之一，可以使用以下代码示例：

// 获取表单字段的值
var fieldValue1 = this.getField("field1").value;
var fieldValue2 = this.getField("field2").value;

// 创建文件夹路径
var folderPath = "/path/to/folders/";

// 根据字段值选择要保存的文件夹
var saveFolder = "";
if (fieldValue1 === "value1") {
  saveFolder = folderPath + "folder1/";
} else if (fieldValue1 === "value2") {
  saveFolder = folderPath + "folder2/";
} else {
  saveFolder = folderPath + "folder3/";
}

// 生成文件名
var fileName = fieldValue1 + "_" + fieldValue2 + ".pdf";

// 保存表单到指定文件夹
this.saveAs(saveFolder + fileName);

在上面的示例中，我们首先获取表单字段的值，然后根据字段值选择要保存的文件夹。您可以根据实际情况修改文件夹路径和条件语句来满足您的需求。最后，我们生成文件名并使用saveAs方法将表单保存到指定的文件夹中。

请注意，上述代码示例假设您已经在Acrobat中创建了一个JavaScript按钮，并将其与上述代码相关联。