如果使用AKS的Windows节点池运行IIS托管的应用程序时遇到性能下降的问题，可能是由于以下原因：

1. 资源限制：Windows节点池中的节点资源可能不足以支持应用程序的负载。您可以尝试增加节点的大小或数量，以提高性能。

2. 网络问题：检查网络连接是否稳定，并确保节点与应用程序所需的其他服务之间的网络延迟较低。

3. 应用程序配置：检查IIS配置以确保它与应用程序的要求相匹配。例如，确认IIS应用程序池的设置是否适当，并且连接池和线程池的配置是否正确。

下面是一些示例代码，可供您开始解决这些问题：

1. 调整节点大小或数量：

apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name: my-app
spec:
  replicas: 3
  template:
    spec:
      containers:
      - name: my-app-container
        image: my-app-image
        resources:
          requests:
            memory: "4Gi"
            cpu: "2"
          limits:
            memory: "8Gi"
            cpu: "4"

2. 检查网络连接：

using System.Net.NetworkInformation;

var ping = new Ping();
var reply = ping.Send("example.com");
if (reply.Status == IPStatus.Success)
{
    Console.WriteLine("Ping successful");
}
else
{
    Console.WriteLine("Ping failed");
}

3. 配置IIS应用程序池：

Set-ItemProperty "IIS:\AppPools\MyAppPool" -name "managedRuntimeVersion" -value "v4.0"

这些示例代码可以作为起点，您可以根据具体情况进行调整和扩展。此外，还建议您检查应用程序的日志和性能监控，以了解更多关于性能下降的信息，并找出其他可能的原因。