当Android应用程序丢失文件时，可能是因为缓存或数据目录中的文件被清除或删除。可以使用以下示例代码进行文件备份和恢复。

1. 备份文件：

public void backupFile(File source, File destination) throws IOException {
    InputStream in = new FileInputStream(source);
    OutputStream out = new FileOutputStream(destination);

    // Transfer bytes from in to out
    byte[] buf = new byte[1024];
    int len;
    while ((len = in.read(buf)) > 0) {
        out.write(buf, 0, len);
    }
    in.close();
    out.close();
}

2. 恢复文件：

public void restoreFile(File source, File destination) throws IOException {
    backupFile(destination, new File(destination.getAbsolutePath() + ".backup"));
    backupFile(source, destination);
}

在需要备份和恢复文件的地方，使用以上代码即可。