在使用auto-py-exe转换.py脚本时，如果遇到错误消息"一个二进制文件添加了两个内部名称"，可以尝试以下解决方法：

1. 更新auto-py-exe：确保你使用的是最新版本的auto-py-exe。可以通过在命令行中运行以下命令来更新：

pip install --upgrade auto-py-exe

2. 检查脚本文件：检查你要转换的.py脚本文件是否存在任何错误或语法问题。确保脚本可以正常运行并且没有任何导入库的错误。

3. 重命名脚本：尝试将脚本文件重命名为不包含特殊字符或空格的名称。有时，auto-py-exe对文件名中的特殊字符或空格不敏感，这可能导致错误。

4. 检查依赖项：确保你的脚本中使用的所有依赖项都已正确安装。可以使用以下命令检查和安装依赖项：

pip install 

5. 使用pyinstaller替代auto-py-exe：如果auto-py-exe仍然无法正常工作，可以尝试使用pyinstaller来将.py脚本转换为可执行文件。pyinstaller是一个功能强大的打包工具，可以将脚本打包成单个可执行文件。

pip install pyinstaller
pyinstaller --onefile your_script.py

这些解决方法应该能够帮助你解决"一个二进制文件添加了两个内部名称"的问题。如果问题仍然存在，请提供更多的代码示例和详细的错误信息以便我们更好地帮助你解决问题。