出现此问题可能是由于网络不稳定或 Atom 软件问题导致的。解决方法如下：

1. 检查网络连接是否正常，尝试重启网络或连接其他网络。

2. 如果问题仍然存在，请尝试使用以下命令重新安装 Atom 软件：

     ```
     sudo apt-get update
     sudo apt-get upgrade
     sudo apt-get remove atom
     sudo apt-get autoremove
     sudo rm -rf ~/.atom
     sudo apt-get install atom
     ```
   

   此过程将更新您的软件包和 Atom 版本，并清理您的旧文件。

3. 如果问题仍然存在，请考虑使用其他软件包管理器，例如 apm 命令或使用其他编辑器。

您还可以尝试在 Atom 软件的设置中更改软件包源：

1. 打开 Atom 软件并进入“设置”。
2. 点击“Install”选项卡，然后单击左侧菜单栏中的“Packages”。
3. 在右侧窗口中，找到“Settings”按钮并单击。
4. 在“Settings”窗口中，找到“Package Sources”一项。尝试切换源，或手动添加源（例如 https://atom.io/api/packages）。
5. 关闭 Atom 软件并重新打开，看看是否已经解决了问题。