adehabitatHR的家域估计过小
创始人
2024-07-27 06:30:33
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adehabitatHR 是一个用于进行动物栖息地分析的R语言包,其中家域是其最主要的输出之一。然而,有时候可能会出现家域估计过小的问题。一种解决方法是通过调整 adehabitatHR 加工数据的输入参数(比如调整参数 unLog, or kernUD)来解决问题。以下是一个示例代码:

#加载 adehabitatHR 包
library(adehabitatHR)

#读取数据
data(puechabonsp)

#默认运行 Gaussian kernel 方法的 home.range 函数
hr_gauss <- home.range(puechabonsp)

#改变 GA 方法的参数 unLog = T,则坐标轴会按对数缩放
hr_log <- home.range(puechabonsp, unLog = T)

#改变 GA 方法的参数 kernUD,则可以控制数据的确定半径
hr_ud <- home.range(puechabonsp, kernUD = "HR")

#将多个家域数据汇聚在一起
HR_list <- list(GA=hr_gauss, GA_log=hr_log, GA_UD=hr_ud)
#绘制家域图
par(mfrow=c(1,3))
for (i in 1:3){
  plot(HR_list[[i]], main=names(HR_list)[i])
}

通过上述代码,可以看到改变了参数后,家域估计的大小会随之发生变化。因此,可以尝试使用 adehabitatHR 的参数调节相关函数来解决家域估计过小的问题。

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