在Appveyor中，可以使用以下步骤将主分支的PR构建运行：

1. 在Appveyor的配置文件（例如appveyor.yml）中，添加一个脚本来检查当前构建是否是来自主分支的PR。这可以通过检查APPVEYOR_PULL_REQUEST_HEAD_REPO_BRANCH变量是否等于主分支的名称来完成。如果相等，则表示当前构建是来自主分支的PR。以下是一个示例脚本：

install:
- ps: if ($env:APPVEYOR_PULL_REQUEST_HEAD_REPO_BRANCH -eq "master") { exit 0 } else { exit 1 }

2. 添加一个条件步骤，仅当上一步的脚本成功时才运行。在这个步骤中，可以指定构建要运行的命令或脚本。以下是一个示例步骤：

build_script:
- ps: Build-Command-Here

完整的示例配置文件如下：

install:
- ps: if ($env:APPVEYOR_PULL_REQUEST_HEAD_REPO_BRANCH -eq "master") { exit 0 } else { exit 1 }

build_script:
- ps: Build-Command-Here

这样，只有来自主分支的PR才会运行构建脚本。