可以使用Entity Framework Core Power Tools插件来生成迁移文件，而不是使用add-migrations命令。另外，可以在DbContext中手动设置可空属性，以避免在生成迁移文件时被禁用。示例代码如下：

public class MyDbContext : DbContext
{
    // DbSet properties here
    
    protected override void OnModelCreating(ModelBuilder modelBuilder)
    {
        // Fluent API configurations here
        base.OnModelCreating(modelBuilder);
    }
    
    public override void InitializeDatabase()
    {
        base.InitializeDatabase();
        
        // Set nullable properties here
        modelBuilder.Entity()
            .Property(e => e.MyNullableProperty)
            .IsRequired(false);
    }
}