要解决Apache Superset升级到3.0.1无法初始化的问题，可以尝试以下步骤：

1. 确保已正确安装和配置Superset的先前版本。确保先前版本的Superset能够正常工作。

2. 升级Superset的依赖项。在终端中进入Superset安装目录，并运行以下命令：

pip install --upgrade setuptools pip
pip install --upgrade apache-superset

这将更新Superset的依赖项到最新版本。

3. 清除Superset的缓存。在终端中运行以下命令：

superset cache clear

这将清除Superset的缓存，以便在初始化期间不会引起任何冲突。

4. 初始化Superset。在终端中运行以下命令：

superset db upgrade
superset init

这将升级数据库并初始化Superset。

5. 启动Superset。在终端中运行以下命令：

superset run -p 8080 --with-threads --reload --debugger

这将启动Superset，并在8080端口上运行。

如果上述步骤无法解决问题，建议查看错误日志以获取更多详细信息，并尝试在Superset的GitHub页面上搜索类似问题的解决方案。