在ADAL到MSAL的迁移过程中，可能会遇到HttpActionContext.ControllerContext.RequestContext.Principal.IsAuthenticated返回false的问题。这通常是由于ADAL和MSAL在处理身份验证时使用了不同的机制所导致的。

下面是一个示例解决方法：

1. 首先，确保你已经将ADAL相关的代码替换为MSAL的代码，并且已经正确配置了MSAL。

2. 在你的代码中，找到使用HttpActionContext.ControllerContext.RequestContext.Principal.IsAuthenticated的地方。

3. 使用MSAL提供的方法来验证用户是否已经通过身份验证。你可以使用AcquireTokenSilent方法来检索用户的令牌，如果成功获取令牌，则表示用户已通过身份验证。

以下是一个示例代码：

using Microsoft.Identity.Client;

// 在MSAL中获取用户令牌
public async Task GetUserTokenAsync()
{
    string[] scopes = { "api:///access_as_user" }; // 替换为你的应用程序ID

    IConfidentialClientApplication app = ConfidentialClientApplicationBuilder
        .Create("")
        .WithClientSecret("")
        .WithRedirectUri("")
        .Build();

    string userObjectID = ClaimsPrincipal.Current.FindFirst("http://schemas.microsoft.com/identity/claims/objectidentifier").Value;

    try
    {
        var accounts = await app.GetAccountsAsync();
        AuthenticationResult result = await app.AcquireTokenSilent(scopes, accounts.FirstOrDefault())
            .ExecuteAsync();
        return result.AccessToken;
    }
    catch (MsalUiRequiredException)
    {
        // 用户需要重新登录
        string redirectUri = HttpContext.Current.Request.Url.GetLeftPart(UriPartial.Authority) + "/Account/SignInCallback"; // 替换为你的回调URL
        string authorizationUrl = await app.GetAuthorizationRequestUrl(scopes)
            .WithExtraQueryParameters($"state={state}&redirect_uri={redirectUri}")
            .ExecuteAsync();
        HttpContext.Current.Response.Redirect(authorizationUrl);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        // 处理其他错误
        throw ex;
    }

    return null;
}

请注意，上述代码中的一些值需要根据你的应用程序进行替换。确保你正确配置了应用程序ID、应用程序机密和回调URL。

通过使用MSAL的AcquireTokenSilent方法，你可以在用户通过身份验证后获取令牌。如果用户需要重新登录，你可以将用户重定向到授权URL以进行身份验证。

希望这个示例代码可以帮助你解决问题。