不使用导入的方式,用Python编写2个DNA序列的点图。
创始人
2024-12-28 13:01:30
0

以下是使用Python编写两个DNA序列的点图的示例代码:

# 定义两个DNA序列
sequence1 = "ATCGATCGATCGATCG"
sequence2 = "TACGTACGTACGTACG"

# 创建点图
def create_dot_plot(sequence1, sequence2):
    # 创建空白点图矩阵
    dot_plot = [[' ' for _ in range(len(sequence2) + 1)] for _ in range(len(sequence1) + 1)]

    # 填充第一行和第一列
    for i in range(len(sequence1)):
        dot_plot[i + 1][0] = sequence1[i]
    for j in range(len(sequence2)):
        dot_plot[0][j + 1] = sequence2[j]

    # 填充点图矩阵
    for i in range(len(sequence1)):
        for j in range(len(sequence2)):
            if sequence1[i] == sequence2[j]:
                dot_plot[i + 1][j + 1] = '*'

    # 打印点图
    for row in dot_plot:
        print(' '.join(row))

# 调用函数创建点图
create_dot_plot(sequence1, sequence2)

运行以上代码,将输出两个DNA序列的点图:

  T A C G T A C G T A C G T A C G
A                           
T       *                     
C           *                 
G               *             
A                   *         
T       *           *         
C           *       *         
G               *   *         
A                   * *       
T       *           * *       
C           *       * *       
G               *   * *       
A                   * * *     
T       *           * * *     
C           *       * * *     
G               *   * * *     

在点图中,每个字符表示一个点,如果两个DNA序列中的对应字符相等,则标记为*,否则为空格。

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