Biopython(SeqIO)'FileNotFoundError'
创始人
2024-12-19 01:01:46
0次

这个错误通常是因为指定的输入文件（例如fasta文件）不存在或路径不正确。解决方法是确保文件存在于给定的路径下，并正确指定路径。下面是一个简单的示例代码来读取fasta文件：

from Bio import SeqIO

# 指定文件路径和文件名
file_path = '/path/to/file/sample.fasta'

try:
    # 读取fasta文件
    records = list(SeqIO.parse(file_path, 'fasta'))

    # 打印序列数目
    print('Number of sequences: ', len(records))

except FileNotFoundError:
    # 打印文件不存在的错误信息
    print('Error: File not found')

在这个例子中，需要根据实际情况修改文件路径和文件名。如果路径和文件名是正确的，并且仍然遇到 FileNotFoundError 错误，则需要检查文件是否存在。

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