要解决Acme自动证书管理器在启动时忽略有效证书的问题，你可以按照以下步骤进行操作：

1. 找到Acme自动证书管理器的启动代码。这可能是一个命令行脚本、一个服务或一个后台进程。

2. 在启动代码中，找到加载证书的部分。

3. 在加载证书的代码前面添加一行代码，用来判断是否忽略有效证书。例如，你可以使用一个配置文件来控制是否忽略有效证书。

4. 如果判断结果为忽略有效证书，则跳过加载证书的代码，并继续执行后面的逻辑。

以下是一个示例的解决方法，假设你使用的是Python脚本来启动Acme自动证书管理器：

import configparser

# 加载配置文件
config = configparser.ConfigParser()
config.read('config.ini')

# 判断是否忽略有效证书
ignore_valid_cert = config.getboolean('General', 'ignore_valid_cert')

# 如果忽略有效证书，则跳过加载证书的代码
if ignore_valid_cert:
    print('忽略有效证书')
else:
    # 加载证书的代码
    print('加载证书')

# 继续执行后面的逻辑
print('其他操作')

在上面的示例中，我们使用了configparser模块来加载一个名为config.ini的配置文件。配置文件中可以包含一个名为ignore_valid_cert的布尔值，用来控制是否忽略有效证书。根据配置文件的值，我们判断是否忽略有效证书，并在加载证书的代码前面添加了相应的逻辑。

请注意，上述示例仅供参考。具体的解决方法可能因你的应用程序和工具的不同而有所变化。你需要根据自己的实际情况来修改代码。