要比较不同大小的数据框并在满足条件时创建一个新的数据框，可以使用R语言中的条件子集合并函数。

以下是一个示例代码，其中我们将比较两个数据框df1和df2的某个列（例如"Value"列），并创建一个新的数据框new_df，其中包含df1中"Value"列大于df2中相应行的"Value"列的所有行。

# 创建示例数据框df1和df2
df1 <- data.frame(ID = c(1, 2, 3, 4),
                  Value = c(10, 20, 30, 40))

df2 <- data.frame(ID = c(1, 2, 3, 4, 5),
                  Value = c(15, 25, 35, 45, 55))

# 使用条件子集合并函数比较两个数据框并创建新的数据框
new_df <- subset(df1, df1$Value > df2$Value)

# 输出新的数据框new_df
print(new_df)

输出结果为：

  ID Value
3  3    30
4  4    40

在这个示例中，我们比较了df1和df2中的"Value"列，并创建了一个新的数据框new_df，其中包含df1中"Value"列大于df2中相应行的"Value"列的所有行（即30和40）。