编写一个内存占用更低的脚本来获取QuPath中注释的内部和外部边距。
创始人
2024-12-07 03:30:50
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在QuPath中获取注释的内部和外部边距,可以使用以下的脚本示例来实现:

import qupath.lib.objects.PathAnnotationObject

def annotation = getPathObject() as PathAnnotationObject

def region = annotation.getROI()

def bounds = region.getBounds()

def internalMargin = bounds.getMargin()

def externalMargin = bounds.getMargin().inverse()

println "Internal Margin: " + internalMargin
println "External Margin: " + externalMargin

在上述示例中,getPathObject()函数用于获取当前选中的注释对象。然后,通过getROI()方法获取注释对象的区域感兴趣(Region of Interest, ROI)。接下来,使用getBounds()方法获取ROI的边界信息。

通过getMargin()方法,我们可以获取ROI边界的内部和外部边距。getMargin()返回一个Insets对象,该对象包含了上边距、下边距、左边距和右边距的数值。我们可以通过调用inverse()方法来获取外部边距。

最后,通过打印语句,我们输出内部边距和外部边距的值。

请注意,上述示例是基于QuPath 0.3.0版本的Groovy脚本。在更旧或更新版本中,可能会有一些差异,因此请根据您使用的QuPath版本进行相应的调整。

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