这两个命令都可以在数据库表中添加新列，但主要区别在于它们的用途和语法。

1. Alter.Table().AddColumn()：这个命令用于修改已有的表，并向表中添加新的列。它是一个DDL（数据定义语言）命令，可以通过迁移来运行。示例代码如下：

using FluentMigrator;

[Migration(1)]
public class AddNewColumn : Migration
{
    public override void Up()
    {
        Alter.Table("myTable")
            .AddColumn("newColumn").AsString().NotNullable();
    }

    public override void Down()
    {
        Delete.Column("newColumn").FromTable("myTable");
    }
}

2. Create.Column().OnTable()：这个命令用于在新的数据库表中创建一个新的列。它也是DDL（数据定义语言）命令，可以通过迁移来运行。示例代码如下：

using FluentMigrator;

[Migration(1)]
public class CreateTableWithNewColumn : Migration
{
    public override void Up()
    {
        Create.Table("newTable")
            .WithColumn("id").AsInt32().PrimaryKey().Identity()
            .WithColumn("newColumn").AsString().NotNullable();
    }

    public override void Down()
    {
        Delete.Table("newTable");
    }
}

因此，这两个命令的区别在于：Alter.Table().AddColumn()修改已有的表，并添加新列，而Create.Column().OnTable()创建新表，并添加新列。