将Helm Chart中的values.schema.json（jsonschema）转换成values.yaml文件需要使用jsonschema2pojo工具。该工具可以将jsonschema转换为Java POJO，并支持转换为YAML格式。

下面是将values.schema.json转换为values.yaml的代码示例：

1. 首先，将jsonschema转换为Java POJO：

java -jar jsonschema2pojo.jar -s values.schema.json -t src/main/java

2. 接着，将Java POJO转换为YAML格式：

ObjectMapper mapper = new ObjectMapper(new YAMLFactory());
String yaml = mapper.writeValueAsString(pojo);

其中，pojo为上一步生成的Java POJO对象。

最后，将生成的YAML格式的内容写入values.yaml文件中：

try (FileWriter fileWriter = new FileWriter("values.yaml")) {
    fileWriter.write(yaml);
}