如果Bazel构建不尊重您的Git子模块，您可以尝试以下解决方法：

1. 确保您的Git子模块正确地被添加到您的Bazel构建配置文件中。在BUILD文件中，使用git_repository规则来引用您的Git子模块。例如：

load("@bazel_tools//tools/build_defs/repo:git.bzl", "git_repository")

git_repository(
    name = "my_git_submodule",
    remote = "https://github.com/example/repo.git",
    commit = "your_commit",
)

2. 确保您的Bazel构建配置文件正确地依赖和使用了Git子模块。在您的BUILD文件中，使用deps属性来声明对Git子模块的依赖关系。例如：

cc_library(
    name = "my_library",
    srcs = ["my_source_file.cc"],
    deps = ["@my_git_submodule//:my_submodule_library"],
)

3. 确保您的Git子模块的文件和目录在您的Bazel构建配置文件中正确地包含和引用。在您的BUILD文件中，使用srcs属性来声明Git子模块中需要包含的源文件和目录。例如：

cc_library(
    name = "my_submodule_library",
    srcs = glob(["my_submodule/**/*.cc"]),
)

4. 如果您的Git子模块是一个C++库，您可能还需要在您的WORKSPACE文件中引用和配置相关的C++工具链和依赖项。

load("@bazel_tools//tools/build_defs/repo:git.bzl", "git_repository")

git_repository(
    name = "my_git_submodule",
    remote = "https://github.com/example/repo.git",
    commit = "your_commit",
)

load("@rules_cc//cc:defs.bzl", "cc_toolchain")

cc_toolchain(
    name = "my_cc_toolchain",
    toolchain = "//toolchains:clang",
    target_compatible_with = [
        "@local_config_cc//:cc_toolchain_type",
    ],
    target_cpu = "your_target_cpu",
)

load("@rules_cc//cc:repositories.bzl", "rules_cc_dependencies", "rules_cc_toolchains")

rules_cc_dependencies()
rules_cc_toolchains()

通过检查和更新您的Bazel构建配置文件，确保正确地引用和使用您的Git子模块，您应该能够解决Bazel构建不尊重Git子模块的问题。