以下是一个示例的Bash脚本，可以将给定目录下的所有子目录中的视频文件进行转换：

#!/bin/bash

# 设置转换参数
output_format="mp4"  # 输出格式
output_codec="h264"  # 输出编码器

# 转换函数
convert_video() {
    input_file="$1"
    output_file="${input_file%.*}.${output_format}"  # 构建输出文件名

    # 使用ffmpeg进行转换
    ffmpeg -i "$input_file" -c:v $output_codec -c:a copy "$output_file"
}

# 遍历目录函数
traverse_directory() {
    directory="$1"

    # 遍历目录中的文件和子目录
    for file in "$directory"/*; do
        if [ -d "$file" ]; then
            # 如果是子目录，则递归调用此函数
            traverse_directory "$file"
        elif [ -f "$file" ]; then
            # 如果是文件，则检查文件类型是否为视频
            file_type=$(file -b --mime-type "$file")
            if [[ $file_type == video/* ]]; then
                # 如果是视频文件，则调用转换函数
                convert_video "$file"
            fi
        fi
    done
}

# 获取用户输入的目录路径
read -p "请输入目录路径: " input_directory

# 调用遍历目录函数开始转换
traverse_directory "$input_directory"

在此示例中，脚本首先定义了要转换的视频的输出格式和编码器，然后定义了两个函数：convert_video用于将单个视频文件进行转换，traverse_directory用于遍历目录并调用convert_video函数。最后，脚本从用户输入中获取目录路径，并调用traverse_directory函数开始转换。