在使用PhpOffice库将文档保存为PDF时，可能会遇到换行符被删除的问题。这可能是因为默认情况下，PhpOffice将文本视为单行内容处理。为了解决这个问题，你可以使用TextRun和TextBreak类来实现换行。

以下是一个示例代码，演示如何在保存为PDF时保留换行符：

addSection();
$paragraph = $section->addTextRun();

// 添加文本内容，包含换行符
$text = "这是第一行\n这是第二行\n这是第三行";

// 将文本内容按照换行符拆分成数组
$textArray = explode("\n", $text);

// 循环数组，为每一行文本创建TextRun对象，并添加到段落中
foreach ($textArray as $line) {
    $paragraph->addText($line);
    $paragraph->addTextBreak();
}

// 保存为PDF文档
$writer = IOFactory::createWriter($phpWord, 'PDF');
$writer->save('output.pdf');
?>

在上面的示例中，我们使用addText()方法向TextRun对象添加文本内容，并使用addTextBreak()方法在每一行之间添加换行符。这样，当保存为PDF时，换行符将会被保留。

请确保已经安装了PhpOffice库，并使用composer加载相应的依赖项。